技术创新
清华产业坚持产学研一体化的发展道路，依托清华大学的科研实力和各成员企业的研发力量，构建起多方位的研发体系，坚持自主创新和持续创新，不断研发具有自主知识产权产品，发展具有自主创新能力、拥有自有核心技术的创新型企业，以科技创新成果服务社会发展。
截至2018年3月底，清华产业与清华大学联合共建科研机构7个，依托国家级重点研究机构7个、教育部研究机构4个；截至2017年底，累计转化国家级重大科技成果56项，实现62项重大技术突破，推动实施3项国家科技重大专项的项目转化；累计申请国内外专利1.8万项；2016年集团研发投入在收入中的占比为6.95%，位居中国500强企业第7位。
与清华大学联合共建机构
● 计算机系统结构联合研究中心（同方股份有限公司、计算机科学与技术系）
● 公共安全应急技术联合研究院（北京辰安科技股份有限公司、工程物理系）
● 安全检测技术研究院（同方威视技术股份有限公司、工程物理系）
● 动态可重构可编程逻辑器件联合研究中心（紫光国芯微电子股份有限公司、微电子
- 学研究所）
● 核检测联合研究中心（北京华力兴科技发展有限责任公司、核能与新能源技术
- 研究院）
● 智能维护保障技术联合研究所（同方工业有限公司、信息技术研究院）
● 泰豪装备联合研究院（泰豪科技股份有限公司、清华大学）
国家重点研究机构
● 摩擦学国家重点实验室（天津华海清科机电科技有限公司）
- ● 数字电视国家工程实验室（北京）（北京数字电视国家工程实验室有限公司）
- ● 下一代互联网核心网国家工程实验室（赛尔网络有限公司）
- ● 危爆物品扫描探测技术国家工程实验室（同方威视技术股份有限公司）
- ● 光盘系统及应用技术国家工程研究中心（北京同方光盘股份有限公司）
- ● 燃气轮机与煤气化联合循环国家工程研究中心（北京华清燃气轮机与煤气化联合
循环工程技术有限公司）
- ● 生物芯片北京国家工程研究中心（博奥生物集团有限公司）
教育部研究机构
- ● 粒子技术与辐射成像教育部重点实验室（同方威视技术股份有限公司）
- ● 辐射技术与辐射成像教育部工程研究中心（同方威视技术股份有限公司）
- ● 生态规划与绿色建筑教育部重点实验室（清控人居控股集团有限公司）
- ● 教育部在线教育研究中心（北京慕华教育科技有限公司）